通案減列部分，包括水電費統刪10%、特別費統刪60%，行政院及所屬、陸委會、原民會、內政部、農業部、數發部、國家通訊傳播委員會（NCC）、法務部、銓敘部、監察院、勞動部特別費全數刪除，均不得流用。
另，軍事裝備及設施統刪3%，其中國防部所屬、海巡署及所屬改以其他項目刪減替代，科目自行調整。媒體政策及業務宣導費，除另有預算案決議外，統刪60%。如總刪減數未達939億7500萬元（約3%），另予補足。
其他爭議提案包括總統府業務費被凍結70％，監察院業務費2億4273萬6千元減列50%、凍結30%，國防部潛艦預算凍結50%，外交部業務費凍結50%，不當黨產處理委員會黨產處理業務項下90%的預算遭刪除。
