傳出柯獲交保返家期間，白營曾派人私下轉達柯，要柯文哲自己跟黃國昌談清楚，交接主席的事情。」隨後，柯文哲隨即即在庭訊表示要辭主席，請黃幫忙，形同為黨主席接班人定調。
不過依照民眾黨黨章，主席請辭後，須在6個月內完成補選。在新任主席誕生前，代理主席由中央委員互推產生。但又因中央委員將於1月19日改選，黃國昌如何維持中央委員與代理主席的資格，成為民眾黨待解套的問題。
根據黨章，民眾黨主席最多可指定3席中央委員，目前由主席指定的中央委員僅有林富男1席，黃國昌未來也可能入列，即可不受中央委員改選結果影響。另外一套劇本，則是讓黃國昌繼續擔任下會期的立法院黨團三長，以保有當然中央委員的資格。甚至民眾黨也曾考慮，讓柯文哲改任榮譽主席。
被問到是否接任主席，黃國昌不置可否，強調民眾黨全黨上下一心，「柯文哲是我們的主席，好不容易出來了，因此現在最重要的工作，就是確保其重獲的自由，不再被賴政府用暗黑手段繼續剝奪，此時此刻對於民眾黨而言，就屬這件事情最為重要，「柯文哲是我們的主席，全黨上下都是主席最堅強的後盾。」
